Principalele activităţi specifice ale Curţii de Conturi sunt cele de control şi de audit public extern. Auditul public extern cuprinde auditul financiar şi auditul performanţei.
Auditul financiar se exercită potrivit Programului anual de activitate, pentru exerciţiul financiar încheiat, asupra conturilor de execuţie ale bugetului general consolidat. Auditul performanţei utilizării resurselor financiare ale statului şi ale sectorului public se face în baza programului său de activitate, atât la finalul, cât şi pe parcursul desfăşurării proiectelor, programelor proceselor sau activităţilor supuse verificării.
Curtea de Conturi decide în mod autonom asupra programului său de activitate, desfăşurându-şi activitatea în baza „Programului anual de activitate”.
Planificarea activităţii de control şi audit public extern se realizează pe două niveluri, multianual (3 ani) şi anual. O planificare multianuală permite Curţii de Conturi urmărirea realizării obligaţiei ca toate entităţile ai căror conducători au calitatea de ordonator principal de credite al bugetului general consolidat să fie supuse auditului financiar, cel puţin o dată la 3 ani. Planul multianual de activitate a Curţii de Conturi poate fi revizuit în fiecare an, prin proiectul de program anual de activitate.
Principiile cu caracter general, aspectele şi elementele avute în vedere la elaborarea proiectului planului multianual de activitate, sunt: independenţa, imparţialitatea şi obiectivitatea formulării propunerilor, potrivit cărora selectarea acţiunilor sau a entităţilor prezentate de structurile de control/audit nu va depinde de interese externe, politice sau de orice alt tip de interese de grup, se va face în mod imparţial, adică fără părtinire şi fără a se ţine cont de alte prejudecăţi şi de criteriile subiective ale persoanelor implicate în procesul de selectare; caracterul realist – presupune includerea în program a acelor acţiuni de control/audit ce pot fi realizate cu resursele şi mijloacele disponibile; atribuţiile Curţii de Conturi; obligativitatea efectuării auditului financiar la toate entităţile ai căror conducători au calitatea de ordonatori principali de credite, cel puţin o dată la 3 ani, cu excepţia celor ale administraţiei publice centrale care vor fi incluse în fiecare an; sectoarele/domeniile care prezintă un grad ridicat de risc; noutăţile legislative, organizatorice sau referitoare la gestiunea publică; experienţa acumulată de Curtea de Conturi în anii anteriori în activitatea de control/audit; dimensiunea şi structura sectorului supus verificării în ansamblu şi a anumitor domenii specifice din cadrul acestuia; sugestiile sau iniţiativele cu caracter general formulate de către Parlamentul României; indicatorii de performanţă stabiliţi pe programe; buna practică internă şi internaţională în domeniul financiar, contabil, fiscal şi de audit; cunoaşterea ramurii şi a sectorului în care îşi desfăşoară activitatea entităţile aflate în competenţa de control/audit a structurii în cauză; rezultatele verificărilor anterioare ale conturilor anuale de execuţie bugetară la instituţiile publice şi ale celorlalte entităţi aflate în competenţa structurii respective, inclusiv modul de implementare a recomandărilor formulate în rapoartele precedente de audit al performanței; schimbările intervenite în structura entităţilor care intră, potrivit legii, în competenţa de verificare a Curţii de Conturi; alte informaţii relevante; sesizările şi reclamaţiile primite de Curtea de Conturi de la persoane fizice şi juridice, informaţiile apărute în mass-media sau din alte surse; evaluarea resurselor materiale şi umane existente la nivelul structurilor.
La elaborarea Programului anual de activitate a Curţii de Conturi, în afara elementelor avute în vedere la planificarea multianuală, se va ţine cont şi de: specificităţile domeniului; includerea cu prioritate în programul anual de activitate a acţiunilor de control/audit pe care Curtea de Conturi trebuie să le efectueze în baza dispoziţiilor legale, a acţiunilor începute în anul precedent şi nefinalizate până la sfârşitul anului, ţinându-se cont totodată şi de solicitările Parlamentului României de iniţiere a unor acţiuni de control/audit pentru verificarea legalităţii unor aspecte sesizate; sesizările şi reclamaţiile primite de Curtea de Conturi de la persoane juridice şi fizice privind activitatea entităţilor din competenţa de verificare, informaţiile apărute în mass-media sau din alte surse, în funcţie de natura informaţiilor şi relevanţa acestora; cunoaşterea numărului total al conturilor anuale de execuţie bugetară ale ordonatorilor existenţi în domeniul respectiv, a nivelului plăţilor nete efectuate de către aceştia în perioada anterioară, a capacităţii de control/audit existente, precum şi a anumitor priorităţi de conjunctură existente; entităţile publice/programele/proiectele sau activităţile care nu au fost supuse verificării în ultima perioadă; entităţile la care din verificările precedente au rezultat deficienţe grave de natură financiar-contabilă legate de gestionarea inadecvată a resurselor financiare publice, nerespectarea legii în administrarea patrimoniului public şi privat al statului şi/sau al unităţilor administrativ-teritoriale, aplicarea unor proceduri de lucru inadecvate, indiferent de volumul cheltuielilor înregistrate şi raportate de entităţile respective; entităţile la care, în urma analizei rapoartelor privind organizarea şi realizarea activităţii de audit public intern, transmise de către persoanele juridice supuse verificării Curţii de Conturi, s-au constatat abateri importante. Prin excepţie, aceeaşi entitate poate fi verificată de mai multe ori pe parcursul aceluiaşi an în cazul existenţei unor solicitări primite din partea Parlamentului - prin hotărâri ale Camerei Deputaţilor sau ale Senatului - sau a unor informaţii privind deficienţe grave la respectiva entitate.
Proiectul de program anual definitivat este transmis spre analiză vicepreşedinţilor şi preşedintelui Curţii de Conturi şi spre aprobare Plenului. După aprobarea de către Plen, Programul anual de activitate a Curţii de Conturi este transmis structurilor de control/audit, în vederea punerii în aplicare.
Pe parcursul derulării, Programului anual de activitate îi pot fi aduse modificări considerate absolut necesare, cu aprobarea Plenului.